Wersje „R” w rodzinie Ducati (i nie tylko) zawsze są najbardziej usportowione. W przypadku 749R obrazuje to mocniejszy, niż w 749 silnik, z nieznacznie większym momentem obrotowym. Zawias Showa z przodu i Sachs z tyłu zastąpił Öhlins, gdzie dodatkowo przedni widelec pokryto azotkiem tytanu. W sportowym motocyklu nie mogło zabraknąć również sportowych hebli. Zatem Ducati 749R otrzymał radialne, czterotłoczkowe wyczynowe zaciski. Podobnie, jak w wersji „S” możemy ustawić pod własne upodobania kąt pochylenia główki ramy w granicach 23,5^o – 24,5^o. Konstruktorom udało się także odchudzić motocykl aż o 4,5 kg.